Diversidad y conectividad genética de tres especies de teleósteos de importancia pesquera en el Pacífico de Costa Rica
La estructura genético poblacional, conectividad y diversidad genética de tres especies de
teleósteos de importancia comercial (la corvina reina, el pargo mancha y el pargo seda) reportados
para el Pacífico Costarricense fue estudiada en las cinco principales áreas de pesca del país
centroamericano [Pacífico Norte (Golfo de Papagayo), Golfo de Nicoya, Pacífico Central, Península
de Nicoya y Golfo Dulce]. La caracterización genética de las poblaciones estudiadas fue realizada
mediante el análisis de la variabilidad de un segmento del gen mitocondrial citocromo oxidasa I. Un
total de 648 muestras de tejido de las tres especies focales fueron colectadas y procesadas para
análisis de ADN, amplificación por PCR y secuenciación Sanger. De estas muestras 359
correspondían a la especie Lutjanus guttatus; 191 muestras a Lutjanus peru y 98 a Cynoscion albus.
Las secuencias con la calidad optima basadas en parámetros como porcentaje de query quote,
porcentaje de similitud con la especie focal e índice E; todas las secuencias fueron editadas, sus
extremos cortados y alineados previo al análisis genético. Las variables estudiadas fueron:
diversidad genética (H, Hd, y π), estructura genético-poblacional y conectividad (valores de
diferenciación genética, Tajimas D y índice de vecino más cercano Snn) para cada una de las especies
estudiadas. Únicamente en las especies L. guttatus (596pb) y L. peru (617pb) fue posible realizar
comparaciones entre más de dos zonas de pesca. Para L. peru se encontraron 47 haplotipos
mientras que para L. guttatus se encontraron un total de 49 haplotipos. Para Cynoscion albus se
presentan datos y se comparan dos zonas de Pacífico (Golfo de Nicoya y Pacífico Central). El área
con mayor número de muestras para todas las especies fue el Golfo de Nicoya. En esta misma área
se registra la mayor intensidad de pesca de país. Para esta especie se encontraron 11 haplotipos.
Los valores de diversidad muestran valores intermedios de diversidad genética al igual que para L.
guttatus las cuales son dos especies de hábitos mayormente estuarinos. En contraste los valores
más elevados de diversidad genética se observan para la especie cuya población presenta un mayor
desplazamiento hacia zonas oceánicas y un mayor periodo de dispersión larval, L. peru. Vale la pena
destacar que en las muestras de C. albus se detectó molecularmente la presencia de otras siete
posibles especies de corvina que son parecidas morfológicamente en etapas juveniles a C. albus
como, por ejemplo; Cynoscion reticulatus, Cynoscion stolzmanni, Cynoscion praedatorius, Cynoscion
orthopterus, Micropagonias brevipinnis, Cynoscion parvipinnis y Cynoscion xanthulus. Por otro lado,
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en Lutjanus guttatus fue interesante la similitud observada entre algunas de las secuencias de COI
esta especie con las de Lutjanus synagris (pargo mancha del Caribe) depositadas para este gen en
el Genebank.
En lo referente a diferenciación y conectividad L. guttatus mostró mayor nivel diferenciación e
identidad poblacional entre los sitios muestreados. Los valores de diversidad indican también menor
tamaño poblacional en L. guttatus que en L. peru (Cuadro 4 y 5). En términos de conectividad para
L. guttatus la zona con mayor identidad genética, mayor diferenciación y menor conectividad con
otras áreas fue el Golfo Dulce. Para L. peru, la ausencia de valores negativos y no significativos en
dos de las poblaciones (Pacífico Central y Golfo de Nicoya pueden ser indicativos de presión de pesca
en éstas. Valores positivos y no significativos de Tajimas D son indicadores de contracción
poblacional (Cuadro 4). Esto se ha demostrado en otras poblaciones naturales
En lo referente a trazabilidad molecular el presente trabajo muestra como hallazgo la presencia de
haplotipos no reportados para las especies estudiadas (haplotipos únicos) lo que indica que es
posible realizar trazabilidad molecular de las especies estudiadas para las zonas de pesca analizadas.
Estos haplotipos han sido depositados en el banco de genes GENEBANK. Asimismo, se diseñaron in
silico tres sondas marcadas y tres juegos de oligos marcados que permitirán la detección y
trazabilidad del ADN ambiental liberado por estas especies en zonas de desembarque, sitios de
acopio y mercados.
La información presentada brinda un aporte al manejo y ordenación efectiva de las poblaciones de
estas especies y proporciona datos que permitirán realizar un monitoreo continuo y trazabilidad de
las poblaciones de estas especies y su salud genética.
Palabras clave: Pacífico Norte, Golfo de Nicoya, Golfo Dulce, Pacifico Tropical del Este, diversidad
genética, conectividad, trazabilidad, sobreexplotación, Costa Rica